經典啟靈藥（迷幻蘑菇、LSD、DMT、Mescaline）與大腦 5-HT2A 受體結合後，會啟動一連串深層的神經反應，使人脫離平常的心理狀態，重塑多個關鍵的大腦網路。
在啟靈藥的影響下，大腦理性控制網路 ECN（Executive Control Network）） 下降，使人難以調用理性模塊，進行理性與邏輯思考（Muthukumaraswamy, 2013）。
同時預設模式網路 DMN （Default Mode Network）下降 ，內在情緒變得更赤裸、更誠實（Carhart-Harris et al., 2012）。
最後是負責感官閘門的丘腦會打的更開，這會讓所有感官訊號被放大數倍，感受到的一切，都會放大（Preller, 2018）。
總結來說，大腦會處於一個極度開放且極度敏感的模式 ，難以控制情緒與思緒。
在安全的狀態與環境使用能被放大成深度療癒與產生洞見，但有不安或陌生環境也會放大成恐懼或失控感（Griffiths, 2016）
因此 John Hopkins、Imperial College 等所有主要研究團隊，都將 Set & Setting 視為實驗設計中最重要的生理安全因素之一，而非儀式文化（Johnson, 2008 ; Griffiths, 2016）。
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- 啟靈藥心境與環境設置 - 目前臨床醫學與研究 （John Hopkins / Imperial College ）使用的 Set and Setting
- 啟靈藥研究的安全標準指南 - 啟靈藥臨床研究最廣為使用的安全標準論文，適合想做這方面研究的研究人員
Johnson, M. W., Richards, W. A., & Griffiths, R. R. (2008). Human hallucinogen research: Guidelines for safety. Journal of Psychopharmacology, 22(6), 603–620.
Carhart-Harris, R. L., et al. (2012). Neural correlates of the psychedelic state as determined by fMRI studies with psilocybin. PNAS, 109(6), 2138–2143.
Griffiths, R. R., et al. (2016). Psilocybin produces substantial and sustained decreases in depression and anxiety in patients with cancer. Journal of Psychopharmacology, 30(12), 1181–1197.
Preller, K. H., et al. (2018). Effective connectivity changes in LSD-induced altered states of consciousness. PNAS, 115(6), E350–E358.
Muthukumaraswamy, S. D., et al. (2013). Broadband cortical desynchronization underlies the human psychedelic state. Journal of Neuroscience, 33(38), 15171–15183.